O projeto "Música na Escola" da Secretaria Municipal de Educação (SEDUC), ensina a mais de 1000 alunos técnicas de instrumentos de percussão, com todo conteúdo rítmico, coreográfico, além da coordenação motora. Hoje, São Sebastião conta com 18 fanfarras estudantis distribuídas ao longo do município, de Costa Norte à Costa Sul.
O Música na Escola, que é coordenado pelos professores Geissler Henrique Duarte, o Gege, e por Romário Amorim, conta com bandas como a de percussão na EM Cynthia Cliquet Luciano, que representa o município em competições; a Banda musical da Topolândia e há, no momento, a implantação de uma banda musical em Juquehy, na Costa Sul e na escola municipal Henrique Botelho, o que completará o atendimento na Costa Norte, Centro, Complexo Topolândia e Costa Sul.